三级心理咨询师证书颁发机构主要负责对具备相应专业知识和技能的心理咨询师进行认证，以确保其在心理咨询领域的专业水平，有多个单位和部门负责办理三级心理咨询师证书的颁发工作。

中国国家人力资源和社会保障部(简称人社部)是负责全国职业资格证书管理的主管部门，其中包括心理咨询师证书的颁发，人社部设有专门的职业技能鉴定中心，负责组织和实施心理咨询师职业技能鉴定工作，报考三级心理咨询师的考生需要通过人社部组织的考试和评审，取得合格成绩后，方可申请颁发三级心理咨询师证书。

各省、自治区、直辖市人力资源社会保障厅(局)也会同当地民政、教育、卫生等部门，共同负责本地区三级心理咨询师证书的颁发工作，这些部门会根据人社部的统一要求，对本地报考成功的考生进行资格审查、考试组织和成绩统计等工作，最后将合格考生名单报送人社部备案，人社部审核通过后，由各地人力资源社会保障厅(局)向合格考生颁发三级心理咨询师证书。

一些专业的心理咨询培训机构和学术机构也会参与三级心理咨询师证书的颁发工作，这些机构会协助人社部等相关部门组织考试、培训和鉴定工作，为考生提供专业的心理咨询知识和技能培训，通过培训和考试合格的考生，可以获得这些机构颁发的三级心理咨询师证书。

需要注意的是，不同的颁发机构可能具有不同的认证标准和流程，在选择报考和培训机构时，建议考生详细了解相关机构的资质、师资力量、教学质量等方面的情况，以确保所获得的证书具有较高的权威性和认可度。

中国三级心理咨询师证书的颁发机构主要包括人社部及各省、自治区、直辖市人力资源社会保障厅(局),以及一些专业的心理咨询培训机构和学术机构，考生在报考和备考过程中，应关注这些机构的相关信息，以确保自己的专业地位和职业发展。